1988年公司开始生产在E34平台5系四门轿车上开发的第二代M5运动轿车，它采用两种直列六缸发动机，排气量为3.6升和3.8升，最大功率315马力和340马力。

      当1990年E36平台的新3系轿车问世的时候，宝马汽车运动股份有限公司紧接着在此基础上开发了相应的M3跑车，M3采用的直列六缸发动机，功率为286马力，它采用了两项新技术，一项是尖端的VANOS可变正时配气系统，是世界上第一种连续无级可变凸轮轴正时的配气系统，它提高了发动机低转速和高转速的扭力输出，另外一项是在发动机管理系统里安装了一块每秒能执行2000万次指令的高性能计算机芯片，提高了发动机的响应速度。

       这一代M3得到了用户和世界各个媒体的宠爱，德国的媒体评选M3为最佳年度轿车，法国《汽车冲击》杂志评选M3为“世纪之车”的最高荣誉。这个时期，连偏重于舒适的敞篷型和四门型3系轿车也被纳入了运动轿车发展的范畴内，而新研制的M3GT跑车更是演绎了当时紧凑型最高性能——发动机功率为295马力。从1992年至1996年，公司还生产了采用M3技术的3系列四门竞赛轿车,1993年约翰尼·赛库托驾驶M3GTR赢得了ADACGT赛的冠军，借着这个势头，M3征服了美国运动汽车市场。    

       80年代后期，人们消费日趋个性化，公司洞察到了这个未来消费的趋势，为适应这个潮流同时也为了开创新的市场，1991年，宝马汽车运动股份有限公司建立了宝马个性化部，它推出了一项在当时看来是创新的服务方式——可以为客户提供根据他们特殊要求而生产的车型，使车子有个性的内饰，特殊颜色的车漆和电子设备等等，宝马汽车运动股份有限公司开创的这个汽车消费方式迅速流行，现在很多汽车生产厂商都都已经效仿。

       在汽车运动事业和市场销售都节节上升的时候，公司组织机构又进行了调整以适应发展的需要，而公司也需要一个新名字以符合新的形象，1993年，宝马汽车运动股份有限公司（BMW Motorsport GmbH）更名为宝马M股份有限公司（BMW M GmbH）。现在的宝马M公司更像是一个小型的汽车公司一样在独立运作，因为它有500多名专家，其中一半负责M汽车，除了进行技术开发外，他们还进行大量的试车研究。  

     1995年，最畅销的M3装上了一台新的3.2升6缸发动机，它是自然吸气发动机发展中的一个里程碑，最大功率321马力，突破了100马力/升，创造了民用自然吸气发动机新的工业性能标准，另一项在M3上的新技术是6速手动变速箱。说到变速箱，宝马M股份有限公司在1996年开发了顺序式变速箱（SMG），并把这个独一无二的高技术产品装在了M3上，和以前M3的变速箱相比，SMG靠电液控制换挡，所以从这时候的M3开始，换挡时就不用踩离合器了，SMG提供了两种手动换挡模式——手动换挡是通过转向柱上的拨片加减挡，或向上推变速杆减挡、向后拉加挡，操作十分方便。另外它还提供了全自动换挡模式，SMG变速箱是现在世界上最出色的变速器之一。 

     1993年，宝马M股份有限公司推出了6升V12发动机，这台发动机采用了双顶置凸轮轴，钛合金的曲柄连杆、铝合金的离合器，最大功率600马力，它工作时的怒吼如一群大象的吼叫，其设计者是传奇人物保罗·罗舍尔，并且他还和南非出生的赛车设计师高登·穆瑞联合设计了以这台发动机为动力的麦克拉伦——宝马F1超级赛车，宝马F1超级赛车有着超级的性能，0-100公里/小时的加速不到4秒，最高时速达到了370公里/小时。1996年，这台发动机取得了非凡的胜利，麦克拉伦—宝马F1超级赛车赢得了法国勒芒24小时耐力赛的冠军，1999年又一次取得了该比赛的胜利。但是在这台超级发动机停产后，宝马M股份有限公司就再也不会生产这类发动机了。   

       1995年宝马集团在英国重新成立宝马汽车运动有限公司（BMWMotorsportLtd），承接了以前属于宝马M股份有限公司的赛车部分的工作，这样集团总部让宝马M股份有限公司把业务集中在宝马M运动轿车、宝马个性车开发生产和宝马驾驶训练学校经营上。

      1997年，M家族的运动车里增加了两个新伙伴——Mroadster和Z3roadster，他们装有和M3相同的321马力发动机，是十足的驾驶机器，他超级的性能和优秀的运动底盘，不仅可以为驾驶者带来驾驶乐趣，在每天的驾驶中也锻炼和提高了飞车的技术。

    1998年，宝马M股份公司的工程师研制成功了第三代M5，他又一次成为了这个级别运动轿车的工业标准，所使用的V8的发动机最大功率为400马力，和前一代M5一样，传动系统为工作极度精确和平顺的6速手动变速箱。     

       2000年，第三代M3问世了，它不仅仅代表了跑车发动机技术发展的顶尖水平，而且它的底盘和悬挂也是运动轿车中的表率。通过令人兴奋和刺激的设计，M3表现出更强大性能和卓越的操控品质，它采用的复合刹车系统，由于使用了浮动式刹车片，和传统刹车系统相比，提升了热刹车性能。这一代宝马M3的技术先进性还可以从下面的数据看出：采用轻量化设计的M3高转速发动机堪与F1发动机媲美，比如在8000转/分的最高转速下，活塞的行程达24米/秒(F1赛车在18000转/分极速下为25米/秒)；在2000转/分的低转速下，以及在大约6000转/分的转速范围内都输出不少于最大扭矩的80%，这使它可以在5.4秒内以4档把车速从80公里/小时提高到120公里/小时。它采用了来自M5的6速变速箱以及传动装置，传动比达3.62：1。用2档就可达到100公里时速，而用6档时在中等转速下就可以达到250公里/小时。它卓越的底盘技术让它成为"操纵最佳"的汽车，而先进的制动技术让它从100公里/小时到完全停下来只需要35米的刹车距离。   

       今天，宝马M系车型除了包括M3双门轿车之外，还有M5四门轿车、M双门轿车以及M双座敞篷跑车。不论是M3和M5，都是他们这个级别运动轿车的领袖，在性能上和技术上不断实现自我超越，达到了运动轿车技术性能的一个又一个新高度。现在宝马M的历史有30年了，30年前的BMW3.0SCL以其300马力的发动机在赛车场上给人们带来惊喜，现在M标记的运动轿车不仅仅给人们带来了汽车运动的激情、快乐，也让人们在日常生活和驾驶中实际感受到M运动车发展的精髓：在运动中不断超越自我，使自己更强大。